מקורות ישראלים מספרים כי לפחות משבוע לפני כן, דיויד ברניה, ראש שירות המוסד, לא השתתף בשום פגישה משותפת עם בנימין נתניהו, ראש ממשלת ישראל.
הסכסוך וההבדלים ביניהם החלו לאחר שנתניהו האשים את ראש המוסד בכך שמסר מידע שגוי על היכולות הצבאיות ומצבם הפוליטי והחברתי של איראן, מה שהוביל את ישראל למלחמה שאין תוצאות ברורות לגביה, והכישלון במלחמה זו עלול ליצור איום קיומי כבד על ישראל.
מקורות ישראלים טוענים כי מצד שני, המוסד סבור כי המידע האמיתי הועבר למשרד ראש הממשלה, אך נתניהו, בהתבסס על רוח הרפתקנית אישית שלו, פתח במלחמה עם תוצאות בלתי צפויות, והאחריות לכישלון האפשרי אינה נופלת על המוסד, אלא ישירה על ראש הממשלה. חלק מהמקורות העבריים אף הרחיקו לכת ואמרו כי משרד ראש הממשלה והמוסד האשימו זה את זה בנוגע לנוכחות סוכנים איראניים והדלפות מידע ממוקדים רגישים צבאיים וביטחוניים בישראל! קודם לכן, בפרשת התקיפה הישראלית בקטאר, משרד ראש הממשלה והמוסד האשימו אחד את השני בהדלפת מידע על התקיפה דקות ספורות לפני תחילת המבצע, ובכך שיבשו את הצלחתה של ההתקפה.
המוסד גם טוען כי דיויד ברניה אמר לראש הממשלה לפני מלחמת איראן כי אם תצא לפועל מלחמה, הרשתות הסודיות של המוסד בדרום המפרץ הפרסי יהיו בסכנה להתקפות מצד איראן, ויש לנקוט אמצעים כדי להגן עליהן (כנראה העברתם למלונות או למתקנים צבאיים), דבר שיביא לחשיפתן ולבסוף להשמדתן!